Generated by All in One SEO v5.0.0.1, this is an llms.txt file, used by LLMs to index the site.

# compevo

comparative & evolutionary biology @ METU Biology

## Sitemaps

- [XML Sitemap](http://compevo.bio.metu.edu.tr/sitemap.xml): Contains all public & indexable URLs for this website.

## Posts

- [Bilim ve politika: Evrim mücadelesi](http://compevo.bio.metu.edu.tr/2022/11/09/bilim-ve-politika-evrim-mucadelesi/?lang=tr) - Türkiye hükümeti evrim teorisine yönelik saldırılarını yoğunlaştırırken, akademik camia da geri püskürtmek için harekete geçti. Bir araştırmacı onlara katılmaya nasıl karar verdiğini anlatıyor. Hikayem, İstanbul Üniversitesi'nde moleküler biyoloji ve genetik okumaya başladığım 2007 yılında başlıyor; bu yıl aynı zamanda son derece muhafazakâr Adalet ve Kalkınma Partisi'nin veya AKP'nin de Türkiye genel seçimlerini ikinci kez kazandığı

## Pages

- [What's new](http://compevo.bio.metu.edu.tr/) - October 21, 2022 - We participated in HIBIT 2022 in MersinWe were in Mersin to participate in the 15th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT 2022). Mehmet Somel gave a talk titled "Ancient Upper Mesopotamia 10,000 years ago: First genomic impressions" while İdil Taç and Hande Çubukçu made the poster presentations "A comparative
- [People](http://compevo.bio.metu.edu.tr/people/) - Previous lab members
- [Lab üyeleri](http://compevo.bio.metu.edu.tr/people/) - Geçmiş lab üyeleri
- [Publications](http://compevo.bio.metu.edu.tr/publications/) - A comparison of ancient DNA yields across ossicles and the petrous bone reveals the best preservation in the stapes and incus.Ekin Sağlıcan, Arda Sevkar, Duygu Deniz Kazancı, Gonzalo Oteo García, Sevgi Yorulmaz, Kıvılcım Başak Vural, Gökhan Çakan, Gökçen Adiloğlu, Duru Buldak, Güneş Duru, Aliye Öztan, Brenna Hassett, Nurcan Kayacan, Aslı Erim Özdoğan, Anders Götherström, Füsun
- [Haberler](http://compevo.bio.metu.edu.tr/) - 15 Ekim 2025 - Yeni makaleUnder the shadow: Old-biased genes are subject to weak purifying selection at both the tissue and cell type-specific levels başlıklı yeni makalemiz yayında! 26 Haziran 2025 - Bu hafta Science dergisinde yayımlanan iki makalemiz, antik DNA yardımıyla Neolitik toplumların yapısını daha önce incelenmemiş detaylarıyla ortaya koyuyor. Dilek Koptekin öncülüğünde yürütülen
- [Yayınlar](http://compevo.bio.metu.edu.tr/publications/) - Pre-processing of paleogenomes: mitigating reference bias and postmortem damage in ancient genome dataDilek Koptekin, Etka Yapar, Kıvılcım Başak Vural, Ekin Sağlıcan, N. Ezgi Altınışık, Anna-Sapfo Malaspinas, Can Alkan, Mehmet Somel (2025)Genome Biology, volume 26, Article number: 6 The population history of domestic sheep revealed by paleogenomesDamla Kaptan, Gözde Atağ, Kıvılcım Başak Vural, Pedro Morell Miranda,
- [Infrastructure](http://compevo.bio.metu.edu.tr/outreach/) - Servers Storage space Wetlab equipment
- [Altyapı](http://compevo.bio.metu.edu.tr/outreach/) - Sunucular Depolama alanı Wetlab altyapısı
- [Funding](http://compevo.bio.metu.edu.tr/funding/) - Current Funding: 2020 - 2023: EU Horizon 2020 Twinning ProjectNEOMATRIX: Mapping the Neolithic expansion in the Mediterranean: A scientific collective to promote archaeogenomics and evolutionary biology research in Turkey (Mehmet Somel; Çiğdem Atakuman, Elif Sürer; with SU, IJM-CNRS and FORTH) 2018 - 2022: ERC Consolidator 2017 GrantNEOGENE: Archaeogenomic analysis of genetic and cultural interactions in
- [Proje destekleri](http://compevo.bio.metu.edu.tr/funding/) - Mevcut destekler: 2020 - 2023: Avrupa Komisyonu Horizon 2020 Twinning ProgramıNEOMATRIX: Akdeniz'deki Neolitik yayılımı Haritalandırmak: Türkiye'deki Arkeogenetik ve Evrimsel Biyoloji Araştırmalarının Teşviki için bir Bilimsel Kolektif (Mehmet Somel; Çiğdem Atakuman, Elif Sürer; SU, IJM-CNRS ve FORTH ile) 2018 - 2023: Avrupa Araştırma Konseyi (ERC) DesteğiNEOGENE: Neolitik Anadolu topluluklarında genetik ve kültürel etkileşimlerin arkeogenomik analizi (Mehmet
- [Research Interests](http://compevo.bio.metu.edu.tr/ornek-sayfa/) - Currently our work is concentrated on ancient DNA and evolutionary genetics. This includes archaeogenomics of humans and domestic animals and population genomics. We work as part of the METU Archaeogenomics Lab. We have also done work on comparative genomics and transcriptomics, including mechanisms of brain aging, the evolution of aging, mechanisms of neurodegenerative disease, and comparative transcriptomics to
- [Courses & Workshops](http://compevo.bio.metu.edu.tr/courses/) - Workshop: Computational Analysis of Ancient Genomes-2022: A renewed version of the Computational Analysis of Ancient Genomes Workshop was held on 7-11 February 2022 free of charge. We covered a wider range of topics in population genetics, including raw data processing, genotyping, PCA, f-statistics, kinship, selection, ROH, qpAdm / qpWave, and ADMIXTURE. Notes from the workshop
- [Dersler & Çalıştaylar](http://compevo.bio.metu.edu.tr/courses/) - Workshop: Computational Analysis of Ancient Genomes-2022: A renewed version of the Computational Analysis of Ancient Genomes Workshop was held on 7-11 February 2022 free of charge. We covered a wider range of topics in population genetics, including raw data processing, genotyping, PCA, f-statistics, kinship, selection, ROH, qpAdm / qpWave, and ADMIXTURE. Notes from the workshop
- [Open Positions](http://compevo.bio.metu.edu.tr/open-positions/) - June 2022 We are looking for a new colleague to work with us in managing our NEOMATRIX project. The details of the position and the requirements can be seen here. November 2020 We are seeking a full-time staff member to work as a project manager in our international science collaboration project NEOMATRIX. You may check
- [Araştırma Alanları](http://compevo.bio.metu.edu.tr/ornek-sayfa/) - Güncel araştırmalarımız antik DNA ve evrimsel genetik üzerine yoğunlaşmıştır. ODTÜ Antik DNA grubunun parçası olarak, ağırlıkla insan ve evcil hayvanlar üzerine antik genom ve popülasyon genetiği analizleri yürütmekteyiz. Aynı zamanda karşılaştırmalı genom ve transkriptom verisi analizleriyle beyin yaşlaması, yaşlanmanın evrimi, türler arası fenotipik farklılaşmanın moleküler mekanizmaları, nörodejeneratif hastalık mekanizmaları gibi konular üzerine de çalışmaktayız.
- [İletişim](http://compevo.bio.metu.edu.tr/contact-us/) - ODTÜ Biyoloji Bölümü'ndeyiz. Ofisler: Oda no. 248 (Mehmet Somel) veya no. 205, no. 234(Lab) Adres: Mehmet Somel Biyoloji Bölümü Orta Doğu Teknik Üniversitesi 06800 Ankara Tel: +90-312-2106460 (M.S.) veya +90-312-2107626 (Lab) E-posta: msomel@metu.edu.tr
- [Contact us](http://compevo.bio.metu.edu.tr/contact-us/) - We are at the METU Department of Biology in Ankara. Offices: Room no. 248 (Mehmet Somel) or no. 234 and 205 (Lab) Address: Mehmet Somel Department of Biology Middle East Technical University 06800 Ankara Turkey Phone: +90-312-2106460 (M.S.) or +90-312-2107626 (Lab) Email: msomel@metu.edu.tr
- [Computational Biology Using R](http://compevo.bio.metu.edu.tr/computational-biology-using-r/) - lecture_week_01 lecture_week_02 lecture_week_03 lecture_week_04 lecture_week_05 lecture_week_06 lecture_week_07 lecture_week_08 lecture_week_09 lecture_week_10 lecture_week_11 lecture_week_12 lecture_week_13 lecture_week_14
- [Bio525 Population Genetics](http://compevo.bio.metu.edu.tr/bio525-population-genetics/) - Population genetics is the quantitative study of allele frequency changes in populations in time and space, and forms the basis of evolutionary biology. This course will cover various models used in modern-day population genetics and applications on real data. Target audience: BIO and GENE students, graduate level or senior undergraduate. Prerequisites: Biometry (BIO220) or equivalent,

## Categories

- [Genel](http://compevo.bio.metu.edu.tr/category/genel/)